莱布尼茨学会分析科学研究所开发新软件首次实现自动检测蛋白质组数据

13.03.2015  16:54

    莱布尼茨学会分析科学研究所的研究人员将可能解决现代生命科学的重要难题:在大量的蛋白质原始数据组中自动检测公开的数据库中未被开发利用的数据。由于数据格式多样、数量庞大,精确查找这些数据一直以来都相当复杂。莱布尼茨学会分析科学研究所的研究人员在最新一期《自然生物技术》(“Natrue Biotechnology”)期刊中表示已研发出新软件,可以自动将数据转化为统一格式并同时开展评估和运用。

    现今重要的数据分析手段之一是质谱分析法,从诸如细胞或组织的繁杂大生物分子中分析各自组成及其数量和变化。通过质谱分析法可以将混合物的不同成分根据质量分离出来,从而得到其浓度和组成。通过这一方法,科学家们虽然可以分析大量样本,但已存在的数据在实际操作中被再次分析和使用的难度很大。大部分数据仍然处于未开发状态,其价值也尚未被世人充分利用。

    莱布尼茨学会分析科学研究所的科研人员为此开发出了“多肽振动筛”程序。这个程序原本只用于捕捉大量原始数据。很快科学家们就意识到,“多肽振动筛”程序可以自动对公开的蛋白质组数据库中数据进行评估运用,从而使得蛋白质组的完整数据周期首次展现在世人面前成为可能。

    与其他软件只有一种算法不同,这个软件同时使用多种算法,提高其分析结果的准确性和可靠性。

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